Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap2lQ7TS74 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms