Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc44a1Q6X893 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms