Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga2Q6P5E6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms