Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BegainQ68EF6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms