Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms