Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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