Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms