Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp4Q61107 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms