Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp7Q60973 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms