Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd5Q5VCS6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tdrd5Q5VCS6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms