Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf145Q5SWK7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms