Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sco1Q5SUC9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sco1Q5SUC9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms