Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp22Q5DU02 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms