Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Rtl5Q5DTT4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl5Q5DTT4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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