Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc114Q3UX62 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms