Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1lQ3USQ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1lQ3USQ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms