Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms