Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssbp4Q3U4B1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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