Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc136Q3TVA9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms