Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hp1bp3Q3TEA8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms