Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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