Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spata18Q0P557 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spata18Q0P557 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms