Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MitfQ08874 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MitfQ08874 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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