Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnn1Q08091 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnn1Q08091 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms