Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah2Q06986 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms