Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emx1Q04742 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emx1Q04742 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms