Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms