Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnb1Q03717 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnb1Q03717 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms