Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl7Q03366 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms