Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax5Q02650 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax5Q02650 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms