Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms