Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Serpina1cQ00896 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms