Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nbr1P97432 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nbr1P97432 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms