Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vgll3P85442 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll3P85442 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms