Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ElocP83940 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ElocP83940 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ElocP83940 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ElocP83940 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ElocP83940 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms