Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SeboxP70368 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SeboxP70368 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SeboxP70368 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms