Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab10P61027 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab10P61027 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab10P61027 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab10P61027 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms