Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdrg1P59048 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdrg1P59048 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms