Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PctpP53808 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PctpP53808 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms