Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa8P50706 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa8P50706 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa8P50706 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa8P50706 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms