Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gadd45aP48316 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gadd45aP48316 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms