Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms