Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col18a1P39061 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms