Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdha1P35486 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdha1P35486 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms