Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prim2P33610 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prim2P33610 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prim2P33610 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prim2P33610 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prim2P33610 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prim2P33610 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prim2P33610 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim2P33610 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim2P33610 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prim2P33610 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prim2P33610 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prim2P33610 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prim2P33610 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim2P33610 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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