Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Casp1P29452 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms