Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kif5cP28738 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms