Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjc1P28229 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjc1P28229 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms