Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms