Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms